Геномные исследования вируса гриппа раскрывают механизмы его эволюции
|
Ученые из мэрилендского Института геномных исследований (The Institute for Genomic Research, TIGR) подвели первые итоги крупномасштабного проекта, посвященного расшифровке генома вируса гриппа. Сравнивая нуклеотидные последовательности разных штаммов вируса, генетики смогли проследить, как эволюционирует грипп.
Были описаны 209 геномных последовательностей вируса гриппа А. Образцы вируса на протяжении пяти лет (с 1999-го по 2004 год) брались у пациентов, посещавших поликлиники штата Нью-Йорк.
Почти все исследованные образцы принадлежали штамму H3N2, так как именно он был наиболее активен в течение данного периода времени. Сопоставляя геномы, ученые смогли отследить изменения, происходившие с вирусом по мере того, как он перемещался по территории штата.
За пять лет работы ученые зафиксировали по меньшей мере три разновидности штамма H3N2 на территории штата Нью-Йорк, причем в некоторые годы эти разновидности встречались одновременно. Даже в пределах такого относительно небольшого региона вирус гриппа обнаружил удивительное разнообразие, а его разновидности нередко обменивались генетическим материалом.
Изучение генома позволяет взглянуть на эволюцию гриппа с прагматической точки зрения, говорится в пресс-релизе Института геномных исследований. Теперь, сравнивая геномы разных штаммов вируса, ученые смогут выяснить, какие мутации сделали тот или иной штамм более опасным и устойчивым к новым препаратам — а значит, смогут понять, как можно этому штамму противостоять.
«Наше исследование показывает, что геномика помогает отслеживать распространение вируса гриппа и создавать более эффективные вакцины», — говорит Элоди Гедин (Elodie Ghedin), глава лаборатории вирусной геномики.
Результаты исследования опубликованы в журнале Nature.
