Россия присоединяется к проекту «Штрихкод жизни»


Сравнительные штрихкоды близких (дрозд и малиновка, шмель и пчела) и далеких (малиновка и шмель) видов (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)
Сравнительные штрихкоды близких (дрозд и малиновка, шмель и пчела) и далеких (малиновка и шмель) видов (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)

15 июня Российская академия наук приняла принципиальное решение о формировании проекта «Штрихкод флоры и фауны России». Этот проект продолжает инициативу всемирного консорциума «Штрихкод жизни» (The Consortium for the Barcode of Life, CBOL), созданного в 2004 году.

Консорциум «Штрихкод жизни» объединяет 69 организаций из 31 страны: естественнонаучные музеи, зоопарки и гербарии, исследовательские организации, правительственные агентства, фонды и биотехнологические компании. CBOL осуществляет свою деятельность на средства, получаемые от фондов по грантам. Цель консорциума — сохранение биоразнообразия на Земле. Но прежде чем его сохранять, надо точно знать, чем мы располагаем, то есть описать его.

Поэтому CBOL создает единую методическую и информационную систему, которая позволит описать все существующие на Земле виды животных и растений (микроорганизмы не в счет) и помочь в идентификации новых, только открываемых видов. Уже описано 1,7 миллионов видов растений и животных. Причем наибольшая доля (почти половина) приходится на насекомых. Недаром биологи говорят: «Бог любит жуков». Однако, по оценкам ученых, сегодня на Земле обитает около 10 миллионов видов. Значит, более 8 миллионов еще предстоит описать.

Количество известных видов разных представителей флоры и фауны (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)
Количество известных видов разных представителей флоры и фауны (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)

По традиции таксономисты и систематики описывают виды словесно — как выглядят, как живут, как размножаются и т. п. «Штрихкод жизни» предлагает новый подход. Идея проста: у представителя любого вида выделить в его митохондриальной ДНК стандартный для всего живого участок, секвенировать его (то есть определить последовательность нуклеотидов) и занести информацию в соответствующую базу данных, размещенную в интернете.

Расшифровка штрихкода (последовательности нуклеотидов) пчелы и малиновки (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)
Расшифровка штрихкода (последовательности нуклеотидов) пчелы и малиновки (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)

Предположим, вы нашли какое-то необычное растение. Чтобы узнать, что это такое, надо определить штрихкод этого растения и сравнить его с уже имеющимися в базе данных. Если расхождение с известным кодом менее 3%, то найденное растение можно отнести к тому же виду, к которому принадлежит штрихкод из базы данных. Если же расхождение заметно больше 3%, то имеет смысл уже говорить об открытии нового вида.

Карманный мобильный секвенатор (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)
Карманный мобильный секвенатор (изображение с сайта www.barcoding.si.edu)

В наше время определение штрихкода (то есть нуклеотидной последовательности) — вполне стандартная процедура. Нужны только аппараты для полимеразной цепной реакции (ПЦР) и автоматические секвенаторы. Однако уже очень скоро на рынке появятся карманные мобильные секвенаторы, напоминающие мобильные телефоны и удобные для работы в полевых условиях. Если вы поймали неизвестную бабочку, достаточно оторвать у нее лапку и засунуть в этот секвенатор. Через какое-то время секвенатор, связанный с базой данных в интернете, сообщит, относится ли ваша бабочка к новому виду или к уже известному. Бабочку, конечно, жалко. Но справедливости ради надо отметить, что прежде для выделения ДНК перетерли бы в ступке десятки насекомых, а сейчас, благодаря новейшим методикам, хватит одной лапки.

Проект «Штрихкод жизни» активно распространяется по всему миру. Теперь и в России займутся штрихкодированием. В первую очередь это коснется исчезающих, редких, особо охраняемых и эндемичных видов растений и животных России.


«Информнаука»

<< Назад